La città, moderna e ben dotata di strade e ferrovie, si trova al centro del Tavoliere, fra il Gargano e i Monti della Daunia.
La provincia è bagnata dai fiumi Fortore a Nord, Ofanto a Sud, e da alcuni torrenti.
L’agricoltura è varia: vite e olivo sono diffusi verso la costa, frutta e agrumi sul Gargano.
Sono presenti boschi con alberi secolari, distese di grano, ma anche zone paludose che permettono l’allevamento del bufalo. Dalle zone paludose passano gli uccelli migratori che provengono dall’Africa e si dirigono verso la Penisola Balcanica.
Al confine con l’Appennino si incontrano paesaggi diversi, con borghi arroccati e spesso disabitati. Il tratto costiero è roccioso presso il Gargano e sabbioso tra Manfredonia e la foce del l’Ofanto.
Molti sono i luoghi di interesse naturalistico, artistico e storico.