Nell’XI secolo esistevano nel territorio varie contee. Uno dei conti si chiamava Ugo I di Molhouse (o de Molinis, oppure Molisio) dal quale probabilmente deriva il nome della regione. Esistono però altre versioni: c’è chi lo collega con Molise, un piccolo centro che si trova in provincia di Campobasso. Ma l’ipotesi più attendibile pare sia la derivazione da “mola”, cioè la macina del mulino. La zona infatti era ricchissima di grano.